子公司與分公司存在諸多顯著差異，具體如下：設立方式：子公司是公司股東依據《公司法》相關規定設立，設立過程需嚴格滿足《公司法》中有關設立條件和投資方式的要求。而分公司則由總公司在其住所地以外的地區，向當地工商機關申請設立，本質上屬于公司設立的一種特殊形式。
法律地位：子公司是獨立法人，具備法人資格，擁有獨立的名稱、章程以及組織機構，在對外經營活動中，均以自身名義開展業務。與之不同的是，分公司不具備法人資格，沒有獨立的名稱、公司章程和組織機構，只能以總公司分支機構的名義進行經營。
受控制方式：母公司對子公司的控制通常并非直接干預，而是通過任免子公司董事會成員以及做出投資決策等手段，間接影響子公司的生產經營活動。分公司的人事、業務以及財產均直接受總公司控制，在總公司規定的經營范圍內開展經營活動。
承擔債務責任方式：作為獨立法人，子公司以自身全部財產為限，對其經營過程中產生的負債承擔責任。母公司作為子公司的最大股東，僅以其對子公司的出資額為限，對子公司經營活動中的債務承擔責任。分公司的民事責任則由總公司承擔。
營業執照：子公司需要領取獨立的營業執照，以此作為其合法經營的憑證；分公司不需要領取獨立營業執照。
產品包裝標注：子公司在產品外包裝上，必須標注自身的名稱和住所。分公司在產品包裝標注上則更為靈活，可以標注自己的名稱和住所，也可以同時標注總公司的名稱和住所，或者僅標注總公司的名稱和住所。
征稅方面：子公司作為獨立法人，母公司和子公司需分別進行納稅，且子公司只有在繳納完稅款后的利潤中，才能按照股東所占股份進行股利分配。分公司并非獨立法人，其實現的盈虧需與總公司合并計算納稅。
